Cuando se copia un archivo "vdi", Virtual Box no permite crear una nueva máquina virtual con la copia puesto que comparte el mismo UUID con el archivo original. Es necesario ejecutar el siguiente comando en la copia del archivo vdi para cambiar el UUID original por uno nuevo. Un vez hecho esto, ya es posible crear una nueva máquina virtual en Virtual Box con la copia "vdi".
sudo vboxmanage internalcommands sethduuid archivo.vdi